数字旗手

本章说明 菜单栏列出了ImageJ的所有命令，它包含八个菜单： * File：基本的文件操作，包括打开、保存、创建新图片，大多数命令看名字就知道什么意思 * Edit：编辑和绘制操作，以及全局设定 * Image：图像显示，包括图像格式的转化、怎样显示等 * Process：图像处理，包括点操作、过滤器和算术运算 * Analyze：图像分析，统计测量、直方图绘制和其他与图像分析有关的操作 * Plugins：创建、编辑和管理插件，列出了用户安装的所有宏、脚本和插件。 * Window：已打开的窗口的选择和管理 * Help：升级，文档资源和版本信息 File菜单 New新

本章说明 ImageJ的用户界面非常简单，包含菜单栏、工具栏、状态栏和工具条。 下面就对这些栏目进行详析。 日志窗口 日志窗口用来显示关于一系列操作的有用信息，可以常用来显示插件和宏所传递的信息。 使用Edit-Options-Misc然后，然后勾选Debug mode，就可以显示该窗口。如果该窗口关闭了，那么ImageJ自动退出debug模式。 状态栏 当箭头放在图片上时，状态栏上会显示像素强度和坐标。 当运行filter后，也会显示事件和处理速率。 当点击状态栏时，Java的版本、已用内存、可用内存、已用内存百分比都将显示。除此以外，每次点击状态栏时，都会强迫Java垃圾回收器运行，这

本章说明 ImageJ的功能可以通过宏、插件和脚本三种形式进行扩展： * 宏：宏是最简单的执行一系列ImageJ命令的方式。ImageJ的宏语言是一种类Java的语言，包含了一系列的控制体、算子和内置函数，可以用来调用内置命令和其他宏。宏的代码存储在以.txt和.ijm为扩展名的文本文件中。 * 插件：比宏更强大、更灵活、也更快，但也更难写和调试。ImageJ的大多数的菜单命令其实是插件。插件是用Java语言编写，后缀是.java源文件，然后编译成.class文件。 * 脚本：ImageJ使用Mozilla Rhino解释器来运行JavaScripts脚本。类似于插件，脚本也对所有的I

开篇说明 ImageJ是一个优秀的开源图像处理工具，本系列是对ImageJ的官方User Guide的学习。 简介 ImageJ是一个基于Java平台的图像处理和分析工具（它的发行版Fiji也提供了其他语言，如Python，的开发接口，Fiji与ImageJ的关系，就跟Ubuntu和Linux的关系一样，即Fiji是ImageJ和它的很多插件的集合发行版），由美国国立卫生研究院NIH所创立和开发。因为它基于Java平台，所以通吃各大平台，如Windows、Mac OS和Linux，只要有Java运行环境即可安装和运行。 ImageJ的功能有： * 显示、编辑、分析、处理、保存和打印8位、

本章说明 这一章主要介绍ImageJ的一些基本概念。 快捷键 ImageJ的快捷键在菜单中都有提示，且区分大小写，比如大写的A表示”Shift+A”。同时还要注意查看”Edit-Options-Misc-Require control key for shortcuts”是否勾选，如果未勾选，则快捷键不用按ctrl。 查看所有的快捷键：Plugins-Shortcuts-List shortcuts ImageJ中所有的操作都是在目前激活的图片上进行的，即最前面的图片。在任意图片上按Enter，都会激活ImageJ的主窗口。 查找宏、命令、脚本和插件：小写的l。 ImageJ的撤销和重做：

该文是对以下博客的摘抄和总结： * 数学之美番外篇：平凡而又神奇的贝叶斯方法 * 一文搞懂极大似然估计 贝叶斯公式的背景 “所谓的贝叶斯方法源于他生前为解决一个“逆概”问题写的一篇文章，而这篇文章是在他死后才由他的一位朋友发表出来的。在贝叶斯写这篇文章之前，人们已经能够计算“正向概率”，如“假设袋子里面有N个白球，M个黑球，你伸手进去摸一把，摸出黑球的概率是多大”。而一个自然而然的问题是反过来：“如果我们事先并不知道袋子里面黑白球的比例，而是闭着眼睛摸出一个（或好几个）球，观察这些取出来的球的颜色之后，那么我们可以就此对袋子里面的黑白球的比例作出什么样的推测”。这个问题，就是所谓的逆概

参考文献 变分自编码器（Variational Auto-Encoder）可以说是深度学习领域的一股清流，没有采用“盲目堆砌各种神经层而乱碰瞎试”的套路，而是将神经网络与贝叶斯概率图结合，是理论指导模型结构设计的范例。深入了解它的原理，可以有助于建立良好的算法设计思想。 本文是对“科学空间”博主苏剑林的三篇博客的摘抄总结（话说苏博主真是沉得下心来研究算法啊。。科普得还那么好。。）： * 变分自编码器（一）：原来是这么一回事 * 变分自编码器（二）：从贝叶斯观点出发 * 变分自编码器（三）：这样做为什么能成？ 以及结合变分自编码VAE的PyTorch实现VAE in PyTorch,来

2018-1-19更新：加入自动安装fcitx，以及安装搜狗输入法。 注：在Linux mint系统下，已自带fcitx，但此时安装搜狗后，fcitx并未识别出sogou。 以下是自己的经验： （1）完全卸载fcitx： 1 2 sudo apt remove fcitx* sudo apt autoremove （2）从搜狗官网下载sogou Linux版，双击安装。 此时其实sogou也能直接用，但经常自己崩溃，所以还要进行下面的步骤。 （3）再次安装fcitx框架： （3.1）从”菜单”——“Preference”——“input method”中安装fcitx，并安装si

2018-5-2更新： 更改abaqus的执行命令，统一使用绝对路径。 在abaqus cae 后面增加-mesa选项，以防有的电脑显卡不支持。 2018-1-12更新： 笔记本重装系统以后，再次安装Abaqus，修复了一些细节问题。 遇到了几个新的问题，并附解决方法。 2017-6-20更新： 在新笔记本上重新安装了一遍，完善了部分流程，修正了部分错误。 本文是在新浪博客Install ABAQUS v6.10 in Ubuntu 12.04 基础上所写，希望可以使大家少走弯路。 原文地址为http://blog.sina.com.cn/s/blog_648bf4210100vx

2018-1-12更新： 电脑重装后再次安装DAMASK，完善文档，遇到了几个新问题，并附解决方法。 DAMASK是马普钢铁研究所开发的一款用于晶体塑性有限元模拟的开源软件。 安装过程如下： 求解器和编译器 DAMASK可以调用三种求解器：MSC.Marc/Mentat，Abaqus和自带的谱方法求解器。鉴于Abaqus用得范围广，这里选择Abaqus作为求解器。DAMASK实际是Abaqus的子程序，因此还需要安装Abaqus的subroutine编译器，即Intel的Fortran编译器。 这两个软件的安装及相互调用在之前的博客中已写过，见here。 Python及其Modules